三度房室传导阻滞的治疗主要是针对病因治疗，比如缺氧、酸中毒也可出现三度房室传导阻滞。及时纠正缺氧、纠正酸中毒，可改善心肌传导功能，从而使三度房室传导阻滞得到改善。
如果是由于心肌炎或者手术出现的暂时性损伤，可使用肾上腺皮质激素，消除局部水肿，口服阿托品、麻黄碱或者异丙肾上腺素舌下含服，来改善三度房室传导阻滞的临床表现。重者要应用阿托品皮下或者静脉注射，或者异丙肾上腺素1mg溶于5%-10%的葡萄糖注射液250ml中，持续静脉滴注，速度为0.05-2μg/(kg.d)。然后进行静脉滴注，进行监测心电图，根据心电图表现、心率调整输液速度，一般都会改善三度房室传导阻滞临床表现，也能让三度房室传导阻滞进行消失。但是也有些特殊情况，例如在药物治疗无效的情况下，只能安装心脏起搏器，安装心脏起搏器的指征是反复的阿-斯综合征发作、药物治疗无效。
一般先安装临时起搏器，观察4周，看患儿的房室传导阻滞是否恢复，如果4周仍然没有恢复，则需要安装永久性的起搏器。永久性起搏器要患儿终身携带，治疗麻烦，甚至安装的永久性起搏器需要定期进行更换。