神经性偏头痛的治疗主要分为三个方面，第一方面可以选择药物治疗，服用药物达到治疗的目的或者服用药物进行预防神经性偏头痛，其次可以配合综合物理疗法，使用一定的物理手法来达到治疗的目的，最后配合心理疏导疗法。
首先在药物方面，如果患者头疼较为剧烈，可以选择镇痛的药物进行治疗，镇痛的药物可以选择非甾体类的抗炎药物进行治疗，也可以选择阿片受体类的药物治疗。如果患者较为烦躁，同时可以配合镇静的药物进行处理，来缓解头疼的症状。
对于神经性偏头痛也可以进行综合物理疗法治疗，比如可以选择针灸治疗或者进行头皮的按摩，使头部完全放松达到治疗的目的或者可以选择烤电等疗法，最后神经性偏头痛的患者也可以进行心理疏导的治疗。