腰椎骶管分先天性和继发性，一般为先天性腰椎骶管。如果没有特殊症状不需要处理，也不需要特殊治疗。除非骶管囊肿较大已影响到神经，进而出现神经症状，如大小便不好或者下肢疼痛，如果排除是其他原因引起的上述症状，可以考虑手术治疗切除囊肿，继而解除压力，症状也能得到缓解。临床单纯的囊肿可以不用治疗。而继发的囊肿，即外伤或者肿瘤也会引起囊肿，可以通过手术切除囊肿。
一旦出现囊肿首先应该到医院就诊，做核磁共振。因为核磁共振对囊肿显示较清楚，包括囊肿的类型。如果囊肿较大且有症状，又排除其他问题，即可进行手术治疗。此外，由其他疾病或者原因而引起的神经症状，并非由囊肿引起，可以不用考虑，只需继续观察，如过几个月再做核磁观察有无变化，如果没有变化便可以不用治疗。