为什么要进行造血干细胞移植，造血干细胞移植的主要目的是治疗血液系统疾病。以下几类疾病可通过造血干细胞移植进行治疗：
1、重型再生障碍性贫血：血液系统非恶性疾病最常见的是再生障碍性贫血，对于重型再生障碍性贫血，药物治疗无效，需要进行异基因造血干细胞移植；
2、地中海贫血：还有华南地区常见的地中海贫血，也属于基因异常疾病。目前只有通过异基因造血干细胞移植才能治愈；
3、骨髓增生异常综合征、急性白血病：目前许多血液系统恶性疾病，比如绝大多数的急性白血病、骨髓增生异常综合征尚缺乏根治性的药物，唯一根治的方法是进行异基因造血干细胞移植；
4、淋巴瘤、骨髓瘤：其他有慢性粒细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病，部分可以通过靶向药物治愈，但是少数药物治疗无效的患者也要进行异基因造血干细胞移植，像淋巴瘤、骨髓瘤等，多数可以通过自体造血干细胞移植来控制病情，但也有一部分需要进行异基因造血干细胞移植；
5、系统性红斑狼疮：部分非血液系统的疾病，比如系统性红斑狼疮等，当药物治疗无效的时候，也可以考虑异基因造血干细胞移植治疗。