排卵障碍不能真正治愈，治疗原则是通过控制排卵障碍，治疗排卵障碍带来的问题，排卵障碍患者通常合并月经问题，甚至是异常的子宫出血，需要结合患者的年龄、生育要求、月经特点进行治疗。
通常是比较年轻的女性，或者是40岁之后的女性卵巢功能减退，容易出现排卵障碍，两者治疗方式不同。当患者没有生育要求时，治疗原则就是止血、调整月经周期，如果患者有生育要求，主要治疗目的是促进排卵，当排卵正常时，月经会相应正常。在排卵障碍的人群中，尤其是青少年，比较容易看到肥胖患者，在做调整月经周期及止血治疗的同时，还需做生活方式的调整，做减重治疗，而且要维持终身。