不典型孤独症一般经过系统、科学的康复治疗能够恢复正常水平，而且一般情况下可以恢复到与正常儿童或者是同龄儿童差不多的水平，比如具有一定的人际交往能力、智力水平以及有很好的兴趣、爱好。对于严重的不典型孤独症有可能很难完全康复，因为不典型孤独症是目前情况下还无法根除的疾病，这是全面性智力发育问题，有可能跟正常的孩子多多少少还有差别甚至在某些方面落后于正常的孩子。
但是积极进行治疗、干预、康复、教育等还是比较关键的，如果是轻度不典型孤独症，积极干预和系统做康复训练，比如做感觉统合训练、言语能力训练、与人交往训练以及自我照料的教育和培训等，都可以让孩子恢复绝大部分功能和智力水平。