小儿慢性扁桃体炎不能自愈，慢性扁桃体炎的发生是由于急性扁桃体炎未彻底治愈反复发作导致扁桃体炎慢性发作，治疗分两个部分，非手术疗法和手术疗法。非手术疗法主要包括：
1、保持宝宝口腔清洁，睡觉前要刷牙，饭后要漱口，可以减少口腔内细菌增生；
2、药物治疗主要针对慢性反复发生扁桃体炎的患儿，使用中药玉屏风颗粒，主要是由黄芪、白术、防风子三味药组成，对于反复发生的慢性扁桃体炎患儿长期使用可以达到益气固表的作用；
3、加强自身抵抗力，积极锻炼身体增强自身抗病能力。手术疗法有适应症，如果孩子反复发生扁桃体炎严重影响到生活质量，经常张口呼吸、打鼾、口臭、扁桃体炎周围脓肿、曾经并发风湿、心肌炎、急性肾小球肾炎，或者由于扁桃体炎长期发作导致患儿经常发生低热找不到原因，建议摘除扁桃体。