先天性肠闭锁根据闭锁的形态主要分为四种类型：
1、I型肠闭锁，肠闭锁肠管外观的连续性没有改变，肠管内有隔膜引起的闭锁；
2、II型肠闭锁，肠管连续性发生改变，闭锁的两端为盲端，中间有一个索带连接，许多患儿的肠管肠系膜有一个V型的缺损；
3、III型肠闭锁又分为两型，即IIIa型和IIIb型，IIIa型是指肠管两端是盲端，中间没有条状索带连接，IIIb型是指闭锁的肠管缺损的肠系膜比较多，远端闭锁的肠管如同用水果刀削下的苹果皮一样排列；
4、IV型肠闭锁为多发闭锁，闭锁的肠段有多处，大部分肠管间有纤维索带连接，酷似一串香肠。
相对来讲，在先天性肠闭锁类型中，IIIb型和IV型闭锁，预后更差。