角膜移植术的适应症，顾名思义，把病变的角膜切掉，换上透明清晰正常的角膜组织。角膜局部，或者是哪一层成分不透明混浊，才需要换，最常见角膜白斑、炎症、外伤、角膜变、，圆锥角膜、肿瘤等等，都会造成角膜的混浊，此时可以进行角膜板层移植，或者角膜的全层，也叫做部分穿透性角膜移植。
角膜板层移植里有上角膜缘干细胞移植、角膜基质移植，浅板层、深板层移植和角膜内皮移植等等，适应症有一些活动性炎症，不能够用药物来控制，只有在活动期时，把病变组织切掉，移植上清晰透明健康的组织，叫治疗性移植，也有纯粹为了美容的目的，眼底不好，有角膜白斑，甚至是板层的，或者有一些是全层的，也进行相应的角膜移植，如美容目的角膜移植。