扁桃体结石看不到一般提示扁桃体结石可能在扁桃体隐窝的深部，一般对于这种情况建议患者去医院让医生用间接喉镜帮助之下进行观察。可以采取以下的办法处理，首先在反光镜的显示之下，医生可以用吸引器或者剥离子通过扁桃体隐窝向里面试探，看能否找到扁桃体结石，如果找到可以逐渐的将其剥离出来。
如果这个办法不行，临床上也可以切开扁桃体隐窝的黏膜，扩大隐窝，将隐窝里面的结石给弄出来。一般对于这种情况，临床上不是特别的提倡，因为扁桃体结石经常可以通过漱口等办法进行处理，通过切开之类的可能会导致局部感染，导致患者出现不适感。