脓毒症往往导致全身多个器官功能受累，其并发症多种多样：
1、呼吸衰竭：出现呼吸困难、气促、口唇发绀、经皮血氧下降和缺氧的症状，做气管插管和呼吸机治疗维持患者肺功能；
2、循环衰竭：包括心功能不全和各种心律失常，可伴有心肌酶谱升高。若经容量符合仍然不能纠正血压，考虑脓毒症休克。
3、肾功能障碍：肌酐升高，少尿或出现酸中毒、电解质紊乱，使用利尿药或做床边血液透析治疗维持肾功能；
4、脑功能受损：意识障碍、癫痫或者谵妄，又称脓毒症性相关性脑病；
5、血液系统：凝血指标异常，全身出血点。
6、消化系统：腹痛，腹胀，腹腔高压及腹腔间隔室综合征。消化道出血。黄疸。
还有内分泌等系统，均会受到脓毒症的影响，产生并发症。