沙眼的治疗有全身和眼局部药物治疗：
一、局部用0.1%利福平滴眼液、0.1%肽丁胺滴眼液或0.5%新霉素滴眼液等点眼，1天4次，夜间使用红霉素类、四环素类眼膏疗程最少10-12周，经过一段时间治疗后，在上睑结膜仍可以存在滤泡，但这并不是治疗失败的依据。
二、急性期或严重的沙眼应全身使用抗生素进行治疗，疗程为3-4周，可口服多西环素100mg，1天2次或红霉素1天1g，分4次口服。
三、手术矫正倒睫及睑内翻是防止晚期沙眼瘢痕形成、导致失明的关键措施。
四、预后及预防。
沙眼是一种持续时间长的慢性疾病，相应治疗和改善卫生环境后，沙眼可以缓解或症状减轻，避免严重并发症。应培养良好的卫生习惯，避免接触传染。