新生儿脑水肿的临床表现与成人有所不同，婴幼儿常不能自述头痛，多表现为烦躁不安，尖声哭叫，甚至拍打头部。婴儿因前囟未闭和颅骨缝裂开，所以头痛都不如成人严重。
第二点主要是喷射性呕吐，颅高压刺激第四脑室底部及延髓的呕吐中枢，而引及喷射性呕吐，与饮食无关，清晨较重。头部的体征上主要有以下表现，前囟膨隆紧胀、骨缝裂开、头围增大、头面部浅表静脉怒张、破壶音阳性等体征，为亚急性或慢性代偿机制，与婴幼儿颅骨骨缝尚未完全闭合、颅骨骨质软及有一定弹性有关，这种代偿抵制常使早期症状不典型。
还有意识障碍，由颅内高压引起大脑皮质的广泛损害及脑干网状结构损伤，使婴儿发生程度不等的障碍，躁动或者狂躁，如果不能及时控制脑水肿，意识障碍迅速加深而进入昏迷状态。