会厌囊肿可能会自己消失，但大部分情况下，可能无法自行消失，需要外界干预。若患者存在明显不适症状时，应积极给予相应措施处理，避免影响正常呼吸而危及生命安全。
1、可能会自己消失的情况：通常会厌囊肿可能因喉部先天发育畸形使黏液管充满黏液，或炎症、创伤等因素影响分泌物排出，逐渐形成囊肿。若囊肿较小，并无明显不适症状，仅在喉部检查发现，可能会自己消失，无需进行特殊处理；
2、一般不会自己消失的情况：但若患者会厌部位囊肿体积偏大时，可能会刺激咽喉部位，出现咽部异物感以及吞咽不适症状，严重时可能会堵塞呼吸道部位，出现喘憋、呼吸困难等症状，有时会并发急性会厌炎，此时一般无法自行消失，应给予正确治疗。
对于无法自行消失的会厌囊肿患者，应在医生指导下给予手术干预，多采用等离子下会厌囊肿消融术或激光等方式，属于微创，术后患者恢复速度快、出血少、疼痛轻、不复发，还应注意进食清淡、易消化食物，避免进食辛辣、刺激食物。