肺结核病原学的检查包括痰涂片、痰培养。
第一种，痰涂片的检查在临床上比较常用，因为它比较简单、快速，而且费用也比较低，但是欠缺一定的敏感性，因为痰涂片检查结果阳性，只能说明痰中含有抗酸杆菌，但它不能够区分是结核性的分枝杆菌还是非结核分枝杆菌，所以它有一定的局限性，对临床有参考意义。如果痰涂片检查结果阳性，同时还要结合肺结核相应的临床症状、影像学的检查，还有有无肺结核的接触史，进一步的判定是否传染上肺结核。
第二种，痰培养，痰培养的检查是肺结核检查的金标准。如果痰中培养出了结核分枝杆菌，就确定传染上了肺结核病，下一步就要进行正规的抗结核治疗。近年来还开展了结核杆菌DNA检测。