新生儿发热首先进行物理降温，因为新生儿的中枢神经系统发育不完善，温度常常会随着周围的温度变化而变化，保持所在温度的适宜，比如保持室内温度在25-28度之间，可以利于发热消退。可以给孩子进行其他的物理降温方法，比如洗温水澡、用温水擦拭身体，重点擦拭脖子、腋下、腹股沟等部位，因为这些部位大血管循行，有利于发热消退。
进行病因治疗，因为孩子发热大多数是由于感染导致的，感染的性质主要包括细菌、病毒、支原体感染。如果由于细菌感染导致发热，要及时应用头孢菌素等治疗，如果治疗不适，导致出现败血症等严重的并发症。