小脑扁桃体下疝的手术一般需要4-5个小时，而前期的准备工作基本上就需要1个小时，包括接送患者的时间以及手术麻醉的时间，还有就是手术铺单子准备的时间，再就是手术从切皮开始算，到最后的缝皮基本上需要2-3个小时。这里占用时间比较多的，而且也一定要注意一点就是病情不同，有的时间也不同。
如果病情而言相对比较简单，不需要额外的增加相应的步骤，2个小时也可以做完。而如果有的病情比较复杂，还需要钉帽系统进行固定，像这样的手术的时间就会相对延长2-3个小时，再就是术后的苏醒相对而言也需要1个小时左右。所以整体而言手术时间在4-6个小时，但是也要根据实际情况进行判断。