甲硝唑可以治疗痤疮，甲硝唑说明书上写的是治疗各种线虫感染，因此有人质疑甲硝唑为什么可以治疗痤疮。甲硝唑也属于一种抗厌氧菌的抗生素，这点在说明书上也是有说明的。导致痤疮发生的痤疮丙酸杆菌也属于厌氧菌的一种，因此甲硝唑可以杀灭痤疮丙酸杆菌从而达到治疗痤疮的目的。主要是针对于中重度炎症性的痤疮，比如痤疮出现红包、脓包有一定效果，而对于黑头及粉刺没有效果。
甲硝唑具体的用法有两种，一种是口服，另一种是外用。口服甲硝唑有副作用，对胃肠道的刺激比较大，因此胃肠道功能不太好的人不建议服用。外用是通过甲硝唑磨成粉倒入炉甘石洗剂中，等炉甘石沉淀后用上清液外涂来治疗痤疮，对于痤疮的红包、脓包效果比较明显。