前列腺穿刺在市级三级甲等医院，单针穿刺费用为60元，通常需要穿刺6-12针。如果在B超引导下经直肠穿刺，则需要支付B超引导费用80元。如果在CT引导下经会阴穿刺，则CT引导费用为220元。临床上通常需要穿刺多点，确定采样的多样性和全面性。如果只行单针穿刺，则阳性率相对较低，故目前在临床上通常采用10-12针的穿刺法，即总费用大约在600-720元左右。
穿刺采用局部麻醉，经直肠穿刺最为常见，但经直肠穿刺术前需要清洗肠道，避免穿刺后形成肠道感染。如果CT引导，则可不经直肠，可以经会阴穿刺，但会阴穿刺时通常穿刺1-2针，因为会阴穿刺时相对点位选择较少，无法做到多点穿刺。