先天性唇腭裂可以进行治疗，而且治疗后的患者同成人并没有太大的区别。针对于唇腭裂，最主要的治疗方法就是手术治疗，还要配合正畸、心理、语音等一系列的治疗，唇腭裂的治疗是长期、复杂、多学科协作的过程。以单侧完全性唇腭裂为例，在3-6个月左右时可以先进行唇裂的修复手术，在1-1.5岁左右可以进行腭裂的修复手术。
如果术后患者的发音明显不清，可以在4岁后再针对于发音进行咽成形的手术，而在第3颗牙，也就是尖牙萌出时，可以进行牙槽脊裂的修补术，而成人可以考虑进行鼻畸形以及正颌手术，通过一系列的手术，配合其它学科的帮助，可以使唇腭裂的患者完全在正常的条件下成长。