焦虑症的物理治疗可以使用脑电治疗或者是经颅磁刺激治疗，脑电治疗通过仪器改变微电的频率，从而刺激神经细胞达到修复，从而治疗焦虑症。经颅磁刺激，可以通过电流改变脑部周围的磁场，从而修复大脑功能来治疗焦虑症。
如果焦虑症非常严重，伴有一些激越行为，如坐立不安或自觉躯体不适，痛苦难忍，存在消极行为的时候或在激越情绪下情绪不稳，容易与他人发生冲突，甚至出现一些冲动毁物伤人。此时可以使用苯二氮卓类药物，同时可以使用无抽搐电休克治疗，无抽搐电休克是物理治疗中的最后一道防线，可以有效的缓解激越行为，让快速的镇静下来。脑电治疗经颅磁刺激和无抽搐电休克，都是焦虑症物理治疗的办法。