支原体是一类没有细胞壁的病原微生物，所以它的感染不能够使用头孢菌素类的抗生素或者青霉素类的抗生素，因为其主要作用机制是破坏细胞壁，支原体没有细胞壁，所以这一类抗生素是无效的。需要选择其他作用机制的抗生素，主要是选择大环内酯类、氟喹诺酮类以及四环素类抗生素。具体大环内酯类抗生素可以选择红霉素，也可以选择阿奇霉素，其它的交沙霉素、克拉霉素也可以进行选择。
根据病情的轻重，可以选择口服或者是静脉应用，这一类抗生素成人或者孩子都是可以使用的。如果选用氟喹诺酮类的抗生素，可以选择左氧氟沙星或者环丙沙星等，需要注意在18岁以下不能够使用。对于四环素类的抗生素，可以选择四环素或者多西环素，也需要注意，在8岁以下不能使用。