洗鼻器的正确使用主要是把生理盐水，或自己用食用盐配制成2%-3%左右的淡盐水放入洗鼻器内，把洗鼻器的冲洗头塞入到需要冲洗的鼻孔，低头张口，当呼气时手捏冲洗球，将盐水冲入鼻腔，冲洗出的盐水从口腔及另一个鼻腔流出。注意冲洗时不可用力过猛，也不要用力擤鼻，避免冲洗的盐水及鼻腔分泌物，通过鼻咽部两侧的咽鼓管进入到中耳，引起急性分泌性中耳炎或急性化脓性中耳炎发生。
通过正确的鼻腔冲洗，可以对鼻腔内任何鼻炎、鼻窦炎治疗，起到很好辅助治疗作用。如果儿童或小儿，可以用生理性海水鼻腔喷雾剂喷鼻清洁鼻腔，起到同样辅助治疗作用。