无痛人流和有痛人流的区别在于手术舒适度、术后并发症、手术费用等方面。
无痛人流一般是在全麻下进行，患者几乎无痛感，手术舒适度较好，过程较为顺利，很大程度上减少并发症的发生。而有痛人流术中无麻醉，患者痛苦比较大，可能会因为挣扎、抵抗等干扰手术进程，手术并发症较多，除了伤害性刺激造成的疼痛、心理恐惧外，还可能引起人工流产综合征，主要表现为心率减慢、血压下降、恶心、呕吐、出汗、面色苍白等。
但是无痛人流增加了麻醉操作，麻醉药物会不同程度地抑制呼吸以及部分神经功能，会提高手术风险。麻醉后需要复苏，一定程度上延长了手术时间，且价格较为昂贵。有痛人流不存在麻醉风险，手术结束后即可离开手术床，进行下一项治疗，费用较为低廉。
有痛人流和无痛人流术后感染的概率无明显区别，患者均需预防感染，一般术后2周需要返回医院复查，术后均需卧床休息。