大豆异黄酮是大豆中的一种植物化学物，由于在体内具有调节雌激素的作用，被称为天然雌激素，也可作为药物使用。一般适量进食含有大豆异黄酮的豆制品，或遵医嘱按剂量服用大豆异黄酮的药物制品，对身体产生的副作用和危害相对较小，甚至微乎其微。但若滥用大豆异黄酮的药物制品，可能会对人的身体造成明显副作用与危害。
1、副作用：如果适量摄入大豆、豆腐、豆干、腐竹等含有大豆异黄酮的食物，一般不会因大豆异黄酮的生物活性而对身体产生副作用。但长期、大量使用含有大豆异黄酮的药物，可能会增加体内激素水平失调，造成内分泌紊乱的风险；
2、危害：含有大豆异黄酮的药物常被用于预防和治疗骨质疏松、糖尿病、阿尔兹海默症、子宫肌瘤、乳腺癌、肺癌等疾病，或作为保护心血管、肝脏等重要脏器的药物。若患者没有遵医嘱用药，随意增减药物用量，会影响大豆异黄酮的药物活性，很可能会影响疾病预后，甚至造成病情加重或诱发疾病等不良后果。孕期或哺乳期随意使用大豆异黄酮药物，可能会导致药物经胎盘或乳汁进入胎儿体内，影响胎儿发育。
大豆异黄酮属于大豆的提取物，需要经过复杂的工序 提纯和配药才能发挥治疗作用，且用药期间需遵医嘱，定期检查激素水平。而普通豆制品中的大豆异黄酮含量非常少，因此并不具有治疗作用，且少量食用后影响不大，也是正常人群补充大豆异黄酮的主要来源之一。