空腹呕吐黄水对身体具有一定的危害。出现这种情况通常多考虑是由于晨起饥饿、饮食不当、植物神经紊乱等生理性因素导致。如果只是偶尔出现不必担心，可以刷牙漱口后饮用温水、局部热敷；或者改善饮食习惯，避免辛辣食物刺激，避免熬夜，通过运动、听音乐等方法缓解不适。但如果长期出现这种情况容易损伤胃黏膜，且空腹时胃内无内容物，呕吐黄水可能加重胃肠道不适症状，严重者甚至可能造成脱水以及消化系统疾病等，则需及时就医诊治。
空腹呕吐的黄水可能为胃液或胆汁，出现呕吐反应时，呕吐的胃液、胆汁或消化道内容物刺激食道及胃肠黏膜，长期如此会诱发腹痛、腹胀、恶心、胃痉挛等消化系统不适症状，易引起胆汁反流性胃炎。另外如果持续刺激胃肠黏膜可能会引起黏膜撕裂，呕吐剧烈者还可能导致贲门黏膜撕裂，出现上消化道出血。例如空腹呕吐胃内容物及黄水时，容易引起黏膜撕裂，会导致上消化道出血，部分患者会出现呕鲜红色或暗红色的鲜血。同时由于呕吐时无法补充营养物质，若症状加重出现腹泻情况，可能导致患者出现脱水。此外，如果患者是先呕吐胃内容物然后呕吐黄水，可能会对食道产生多重损伤，长期反复 刺激易导致黏膜炎症，最后可能引发局部黏膜肠上皮化生。因此如果长期存在空腹呕吐黄水需就诊检查。
如果是孕早期由于激素的影响，导致空腹吐黄水的症状，频发呕吐者会影响进食，会对母体和胎儿的健康造成不良影响，建议及时就诊，必要时进行补液治疗。