红心火龙果和白心火龙果营养上没有太大的区别，主要在于有机色素、花青素的含量上。二者均含有较多营养物质，如膳食纤维、维生素、胡萝卜素、花青素等，适当食用均对身体有益。
通常情况下，红心火龙果中的糖分相对较高，食用口感较好，红心火龙果中所含的膳食纤维、花青素、维生素C、胡萝卜素等含量均较白心火龙果略高。膳食纤维可促进胃肠蠕动，一定程度上可改善便秘症状；维生素C有助于提高人体免疫力；胡萝卜素为对抗自由基最有效的抗氧化剂之一，可以保护眼睛晶体的纤维部分。
另外，火龙果籽油对人体癌细胞的增殖具有一定抑制作用，因此，日常生活中适当食用火龙果存在较多好处，两种火龙果均可选择。但需注意过敏体质的人群食用前需进行过敏测试，还需注意避免食用过多，注意洗净后再切开食用，以免病菌污染。