新生儿溶血性贫血大部分可以治愈，但不是所有的都可以被治愈，比如先天遗传性的地中海贫血、遗传性球形红细胞增多症等较难治愈。
临床最常见的新生儿溶血性贫血是血型不合所致，大多是ABO溶血，或者是Rh血型不合导致的溶血性贫血。这种贫血常发生在婴儿出生时，所以只要在婴儿出生的时候给予及时治疗，严重时可以进行换血治疗，通常可以治愈，之后也不会再发生。
部分新生儿出现溶血性贫血是先天性疾病，如先天性遗传性地中海贫血，由于先天遗传因素导致，临床上比较难治愈，可以通过诱因预防，尽量避免贫血发生或者加重。对于遗传性球形红细胞增多症，这类溶血性贫血可以在孩子满6岁之后积极进行切脾治疗，通常能够达到缓解的效果，使贫血纠正、黄疸消失，虽然不能治愈，但是症状能够明显缓解。