扁桃体发炎常见于上呼吸道感染，可由多种致病微生物感染引发，表现为程度不等的咽部黏膜和淋巴组织炎症，具体用药需依据感染类型决定，在医生的指导下使用。
1、细菌感染：常见的致病菌为乙型溶血性链球菌，其次为葡萄球菌、肺炎链球菌等。此时抗感染注射液的主要成分应对这些细菌敏感，常使用的药物有青霉素类如注射用阿莫西林钠，头孢类药物如头孢哌酮注射液和头孢呋辛钠注射液等，其他如红霉素和林可霉素可用于对青霉素过敏者；
2、病毒感染：以腺病毒、鼻病毒、单纯性疱疹病毒等感染居多，可选用利巴韦林注射液进行治疗。
此外需要注意，扁桃体发炎治疗时以口服抗生素或抗病毒药物为主，当扁桃体炎症程度较重或者口服控制不佳时，才采用注射治疗。若扁桃体过于肥大或扁桃体反复发炎，医生还可能建议行扁桃体切除术。在治疗期间宜进流质饮食及多饮水，加强营养，避免食用辛辣刺激性食物，禁烟酒，加强体育锻炼，合理休息等。