碘伏对真菌有作用效果，碘伏通常应用于手术部位的皮肤消毒，也用于烫伤、化脓性皮肤炎症的局部消毒或者皮肤真菌感染的治疗。
碘伏为碘载体的不定型络合物，其中含有80％-90％的结合碘可解聚成游离碘，不仅浓度大、杀菌力强，而且无味、无刺激性、无致敏性、毒性低，是一种广谱杀菌剂。能够有效杀灭病毒、细菌、芽孢、真菌及原虫。在15ppm浓度下，1分钟内能杀死各种细菌的繁殖体，杀死真菌需要1.5小时，杀灭芽孢则需要更长时间。在150ppm的浓度下，10分钟即能破坏乙肝表面抗原。在消毒浓度下，碘伏通常为红色或琥珀色，当其浓度下降到10ppm以下时，则变为白色或淡黄色，失去杀菌活性。
医用碘伏通常浓度在1％以下，呈浅棕色，相比于碘酒、酒精，刺激性更小，可直接用于黏膜处的消毒。不过使用时需要注意，对碘过敏和烧伤面积大于20％者禁止使用，也不宜与红汞同时使用，以免造成不良后果，建议使用前咨询医生，遵医嘱使用。