在患者不了解颅骨修补方面的知识时，肯定会觉得材料的选择还是自己的更好。不敢尝试别的材料进行修补，担心材料和自生组织不相容，或者术后不够美观自然等等问题。但医生却不不建议选用自体骨做材料，这是因为虽然相较于其他材料，自体骨材料已经相对成熟，但是还是有其他风险的可能性的。
首先，材料是有限的，人类的骨骼是如此之小，修补头骨可能会造成另一个缺陷；此外，有必要开辟第二个手术区域，这更具创伤性和风险性。在许多情况下，自体骨在移植后可能被吸收，也存在自体骨结构形状固定、成形困难等问题。因此，自体骨修补材料逐渐也被放弃。
随着医疗水平的不断进步，颅骨修补材料的选择也更加优越。目前合适的颅骨修补材料首选是钛网材料和聚醚醚酮材料。Peek材料目前先进的治疗颅骨缺损的材料，一种与人体自身颅骨相当的高分子材料。生物相容性更高，它虽然坚固但是很有弹性和韧性，抗击能力更强，防护性能更好。舒适度也更高。具有很强的隔热性能。不会有冷热反应敏感的情况发生。术后也不会出现感染，不会有排斥反应。射线可透过，不形成伪影。
更重要的一点是聚醚醚酮是一种可以三维塑性的材料，可以根据患者的不同需求进行三维重建定制。根据患者的脑部CT数据进行设计，利用3D打印技术制作出与骨窗完美匹配的颅骨修补后的颅骨和自身颅骨基本无异。但是对国内从事做peek颅骨的医生技术和专业性也会有较高的要求。所以如有患者需要对此进行治疗，还是建议选择更加权威性的医院。