核磁共振检查没有辐射，对人体无害。但是如果患者体内有不防磁的金属，或植入心脏起搏器，须禁止做核磁共振成像检查，以免发生意外。
核磁共振成像原理是将人体至于特殊的磁场中，用无线电射频脉冲激发人体内氢原子核，引起氢原子核共振，并吸入能量，停止射频脉冲后，氢原子核按特定频率发出射电信号，并将吸收的能量释放出来，被体外的接收器收入，经电子计算机处理获得图像。由于磁共振是磁场成像，而不是X线，没有放射性，所以对人体无害，非常安全。但是部分金属物质以及能够受到磁场作用的东西，如无线电器材、手表等带有金属的设备，以及身体内有植入的金属医疗设备，如起搏器、支架、义齿等，此类物质会影响核磁的图像清晰度，同时有可能对患者产生损伤。
此外，有一种钛合金可以做核磁检查，但需由核磁检查医生确认。钛合金设备如脊柱支架，可以做核磁共振，但是也有可能导致骨支架附近核磁图像失真、出现伪影，进而影响检查的效果。