男性感染HPV的转阴时间与其类型有关，不可一概而论。部分高危型转阴时间较短，约需6-8个月，严重者可能在两年内才能完全转阴。
男性感染HPV病毒主要分两种，高危型和低危型。低危型包括HPV6型和11型等，可引起生殖器疣，如尖锐湿疣，容易通过性生活传播。高危型即HPV16型和HPV18型，主要与肛门癌、口腔癌等有关。目前HPV病毒没有有效的药物治疗，可通过自身的免疫能力达到自愈。单纯HPV感染定期复查即可，不需要药物干预，如果有外生殖器部位病变，需要病理检查以明确诊断，并采取相应治疗。
此外，患者生活中应保持尽可能少的性伴侣，性交时使用避孕套，一定程度上可避免HPV感染，同时应禁烟酒。