新生儿感染性肺炎疗程为5-15天左右，但严重的新生儿肺炎疗程可达20多天，甚至1个月。
新生儿的免疫功能未发育完善，易造成病原菌的感染，从而引发肺炎。若仅为细菌感染引起的肺炎，5-10天左右即可出院。但若为支原体或病毒感染引起的肺炎，甚至出现其它严重并发症，需2周以上才可痊愈出院，期间甚至需配合呼吸机辅助通气，防止引起窒息死亡。此外，治疗期间其它的支持治疗亦较为重要，包括体温稳定、液量平衡、药物治疗等。
此外，新生儿肺炎治疗期间，还可采取物理方法帮助其降温，且家长需为孩子多喂水，以免发生脱水现象。期间喂奶量稍减少，尽量减少患儿胃肠道负担，且宝宝出院以后需注意保暖，避免受凉。