亚甲炎的自然病程约2周左右，但根据个体情况、治疗方式等不同，部分患者的恢复时间也会相应延长。
亚甲炎即亚急性甲状腺炎，是一种感染性疾病，具有自限性。呼吸道病毒感染容易诱发此病，患者常会在发病1-2周前出现呼吸道感染，此后可能会出现咳嗽、咳痰、发热、乏力以及甲状腺区域的疼痛，局部可出现硬结。症状轻微的患者，可不采用药物治疗，通过自身抵抗力的作用，一般1-2周可以逐渐恢复，但具有复发性。对于症状严重的患者，需要采取镇痛消炎类药物或非甾体类药物，症状可能会有所缓解。另外，若症状依旧不缓解，可以短期规范使用激素类药物，但切不可长期使用。
建议患者注意休息，合理饮食，多吃蔬菜、水果、富含蛋白质的食物，尽量避免辛辣刺激的食物。