整肠生主要用于治疗菌群失调引起的肠道功能紊乱，大约需要吃2-3天。
菌群失调引起的肠道功能紊乱主要是由于肠道的微生物平衡状态被打破，益生菌成为了弱势菌群，致病菌成为了优势菌群，大量致病菌积气所产生的毒素导致肠道黏膜受损、水肿等表现，从而出现大便次数增多，肠道平滑肌痉挛，引起腹部疼痛等不适症状。服用整肠生后，患者肠道内的地衣芽孢杆菌活菌、乳酸杆菌、双歧杆菌等益生菌群增加，使得肠道的的微生物处于平衡状，此过程大约需要2-3天。
此外，患者需注意过度摄入和补充整肠生，不仅不能对人体产生积极作用，还可能导致人体脏器负荷过重，产生负面作用，从而严重扰乱肠道环境。