孕妇熬夜一般不会导致胎儿发生畸形，但是经常性地熬夜会影响孕妇的健康，容易出现疲劳感。
容易引起胎儿畸形的原因包括：孕早期接触放射线，以及化学药剂、农药和某些药物，长期大量饮酒；孕期感染某些微生物，如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、弓形虫病毒、梅毒等；孕期高血糖孕妇早孕期血糖控制差，还有叶酸缺乏，另外还有遗传因素等。
因此，建议进行孕前检查，若患有某些疾病治愈后进行怀孕；怀孕前三个月开始服用叶酸，高危孕妇行产前咨询；怀孕后定期产检，避免接触不良环境和药物，戒酒戒烟；如果需要用药时应咨询医生，避免用药不当影响胎儿。