扁桃体肥大不一定能自愈，需根据患者的具体情况而论。
扁桃体肥大的病因较为复杂，多数患者是受到细菌和病毒的感染，尤其是细菌感染，最常见的病原菌是溶血性链球菌、葡萄球菌和肺炎球菌。如果是青春期以前的小朋友，控制扁桃体不经常的反复发炎，扁桃体会逐渐萎缩，就可以自愈；如果炎症反复发作，呈加重趋势，应进行手术治疗。但如果是成人的扁桃体肿大，因为很难让肿大的扁桃体完全消肿，而且还会经常的反复发炎，甚至引起扁桃体化脓的情况，这种情况不可能自愈，需要手术治疗。
建议平时一定要注意扁桃体的变化，出现肥大症状后，要尽快去医院耳鼻喉科治疗。饮食上需要合理安排，避免辛辣、刺激性食物，多饮水。