婴儿喉咙有痰是否会自愈，主要根据婴儿自身抵抗力、病因以及病情严重程度而定。
如果是因为室内空气过于干燥的原因所导致，期间并没有出现实质性的呼吸道感染，此情况可以自行调整空气湿度后自愈。如果喉咙有痰是因为上呼吸道感染，比如普通感冒的原因所引起，患儿没有鼻塞、流鼻涕等症状，且自身抵抗力比较好，一般经过精心护理后7-10天，其症状也能逐渐消失。但是若咳嗽有痰并合并有高烧，要注意做好退烧措施，期间还要注意补充水分，避免脱水而引起电解质紊乱。如果是下呼吸道感染，是由支气管黏膜分泌物或是肺部炎症造成，伴有咳嗽、吐奶等表现，而宝宝抵抗力比较差，这种情况下大多不能自愈，需要由专业的医生来指导治疗。
由于婴儿抵抗能力和免疫力较弱，家长应注意合理喂养宝宝，保证室内温度适宜，避免带婴儿去人多的场所，以免身体健康受到不良影响。