肝内胆管结石是积聚在引流肝段的胆管内，会引发肝脏萎缩和肝硬化。并且结石产生后就不会无缘无故的消失，因此肝内胆管结石是不会自己痊愈的。
肝内胆管结石在发病初期并没有太大的临床表现，因此很容易被忽略，急性发作之后可能会出现右上腹疼痛并伴有发热的症状，但是如果部分病人胆道感染时，整个胆道系统梗阻时会出现黄疸，如果不及时治疗，在后期结石遍及肝内外胆道系统时，可出现胆汁性肝硬化，肝萎缩、肝脓肿等严重的并发症，对人体的健康有很大的危害。因为肝内胆管结石的产生多是局部远端肝内胆管狭窄，胆汁排泄不畅，引起结石的形成，因此当结石产生后也很难从肝段的胆管内排出来，所以肝内胆管结石一般是不会自愈的。即使服用药物也很难达到彻底去除的效果。没有症状的肝内胆管结石的病人可以选择观察，无需手术。而有反复胆管炎发作的肝内胆管结石的病人是需要通过手术的方式把肝胆管内的结石取出来，才能够达到治愈的目的。
确诊有肝内胆管结石的人群，而是需要及时就医，听从专科医生的指导，在平时的饮食中要以清淡为主，不要吃生冷、辛辣、有刺激性的食物。