麻痹性斜视是由于中枢神经系统发出的神经冲动经过一系列的传递，最终引起眼球运动的结果，病因可以分为先天性和后天性两大类别。
神经冲动从皮层下中枢传递到脑干内的眼球运动神经核，然后通过眼球运动神经传递到肌肉，最终引起眼球运动。由于一条或多条眼外肌麻痹使眼球运动失去平衡，原在位或其他诊断眼位出现斜视，这种斜视称为麻痹性斜视。
麻痹性斜视的先天性病因包括支配眼球运动的神经核、神经或眼外肌发生病变，如先天性神经核发育异常等。后天性病因则更为复杂，常见的有内分泌异常、代谢异常、中毒、重症肌无力、颅内肿瘤、外伤、血管性病变、脑膜炎、脑炎等。
这些病变可能发生在大脑角海绵窦、眼眶、领面部组织、鼻窦等部位。因此，麻痹性斜视多为全身疾病，眼部病变仅仅是其中的一个部分。
需要注意的是，麻痹性斜视的治疗不仅仅是针对眼部病变的治疗，还需要关注全身疾病的治疗和康复。
参考资料：张爱霞主编,新编眼科常见病治疗方案,江西科学技术出版社,2019.10