使用四环素可能会引起胃肠道反应、肝脏受损、变态反应，另外，对于血液系统、中枢神经系统也可能会产生一定的影响。
1、胃肠道反应：口服四环素可能导致恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应，有时甚至会引起食管炎和食管溃疡。
2、肝脏损伤：脂肪肝变性患者和妊娠期女性使用四环素后容易发生肝毒性，也可能发生于没有这些情况的患者。胰腺炎也可能与肝毒性同时发生。
3、变态反应：使用四环素后，一些人可能会出现斑丘疹和红斑，少数人会出现荨麻疹、血管神经性水肿、过敏性紫癜、心包炎以及系统性红斑狼疮皮损加重等，但这种情况并不常见。
对于血液系统，使用四环素可能引起溶血性贫血、血小板减少、中性粒细胞减少和嗜酸粒细胞减少。另外，使用四环素可能引起良性颅内压增高，表现为头痛、呕吐、视神经乳头水肿等症状，停药后可缓解。
如果长期使用四环素，可能导致耐药金黄色葡萄球菌、革兰阴性菌和真菌等感染，严重者可导致败血症。另外，还可能减少人体内正常菌群的数量，导致维生素缺乏，出现口干、咽炎、口角炎和舌炎等。
需要注意，如果是存在四环素类药物过敏史的人群， 则禁止使用四环素。
参考资料：陈淑凤，朱瑞霞，孟祥磊主编,呼吸系统常见疾病诊疗与护理,中医古籍出版社,2009.09,第58页