糠秕孢子菌性毛囊炎的治疗主要包括局部治疗和系统治疗，患者需要根据自身情况，在医生指导下选择合适的方法治疗。
1、局部治疗：主要是使用抗真菌药物，如咪康唑、酮康唑、克霉唑、益康唑、联苯苄唑乳膏等，同时可以使用含有抗真菌成分的香波洗澡，如酮康唑香波等，以及二硫化硒洗剂。
2、系统治疗：主要是口服抗真菌药物，如伊曲康唑、氟康唑等，但需要注意对肝脏功能的影响，需要在医生的指导下使用。
此外，对于病情较重的患者，可以考虑使用物理治疗，如光动力、紫外线等，促进患处血液循环，缓解患者症状。
参考资料：曹元华，陈志强主编,中国女性皮肤病学,中国协和医科大学出版社,2009.12,第203页