男孩子12岁阴茎没有发育，可能是正常现象，也可能与包茎、隐匿性阴茎、小阴茎有关，需要积极处理。
1、正常现象：此时还没有进入青春期，进入青春期后，男孩的睾丸和阴茎会发育，会出现第二性特征，如阴毛、腋毛、喉结会出现。
2、包茎：包皮口紧、小，包皮过长，阴茎头无法外露，狭小的包皮口会限制阴茎的发育，可以通过包皮环切术来治疗。
3、隐匿性阴茎：也叫埋藏性阴茎，此病患儿阴茎体埋藏在皮下，外观上看显得阴茎短小，按压阴茎周围皮肤使阴茎体可以外露，但松开手时阴茎体又回到皮下，多见于肥胖的患儿，通过减肥后可以缓解，无法缓解者可通过手术治疗。
4、小阴茎：患儿多有激素分泌不足的情况，需到内分泌科进行就诊，查明原因后可以进行药物治疗或理疗。