吃藿香正气丸反而出现腹泻，可能是体质不适宜，脾虚或者是不对症所引起，建议进行针对性治疗。
藿香正气丸是由广藿香、紫苏叶、白芷、白术、陈皮、半夏、厚朴、大腹皮、桔梗等组成，具有解表化湿、理气和中的功效，通常用于暑湿感冒、头痛身重、胸闷和恶寒发热、脘腹胀痛、呕吐泄泻。
对于风热感冒和脾胃虚寒的患者是慎用的，风热感冒患者会出现恶寒发热、发热比较重、头胀痛、有汗、咽喉红肿、疼痛、咳嗽、痰粘或黄，以及鼻塞黄涕、口渴喜饮、舌尖边红、苔薄白微黄等症状，多见于春季外感风热所致，吃藿香正气丸也是不适合的。
此外，脾胃虚寒的人可见纳呆腹胀、脘腹疼痛而喜温、喜按，以及口淡不渴、四肢不温、大便溏泻或四肢浮肿、畏寒喜暖、小便清长或不利，妇女的主要表现为白带清稀而量多、舌淡胖嫩、舌苔白润、脉沉迟。
服用藿香正气丸应谨遵医嘱，不可盲目用药，且用药期间避免进食难以消化或者是生冷、寒凉食物，如红薯、雪糕等等。