后脑部疼痛除了脑外伤、脑卒中、脑肿瘤、原发性头疼外，还应考虑与视神经脊髓炎有关，还可能与脑积水有关，需要予以明确。
1、视神经脊髓炎：此类患者可以出现肢体无力、麻木、看东西困难、视野缺损等，大部分患者也可以出现后脑勺疼痛。查脊髓磁共振、头磁共振可见异常信号，查腰椎穿刺可见异常，IgG指数可>0.7。患者可以有发热的前驱感染，继而诱发无菌性免疫异常的症状，患者可以有风湿系统疾病，例如系统性红斑狼疮，需要查抗心磷脂抗体。一般可以应用激素以及免疫抑制剂，来进行治疗。
2、脑积水：后脑部疼痛，还可能是脑积水的表现。急、慢性脑积水均可以出现头痛，还可以出现步态障碍、行走困难、尿便障碍等。查头磁共振显示脑室增宽、脑积水。可以到神经外科就诊，进一步明确脑积水的原因。如果脑积水量逐渐增多，或者症状进行性加重，可能需要继续手术治疗，也可以给予心脑静、胞磷胆碱等药物。