奥美拉唑对肝脏可能有一定的损伤，奥美拉唑是脂质泵抑制剂，主要可以抑制胃酸用于治疗胃食管反流性疾病、糜烂性反流性食管炎与其他抗菌药物联合治疗，根除幽门螺杆菌感染，以及治疗幽门螺杆菌相关的十二指肠溃疡、胃溃疡等疾病。
奥美拉唑整体的不良反应较轻，但也会出现一些不良反应，比较常见的是胃肠道反应，包括口腔炎、胃肠道念珠菌感染，还可引起血液系统不良反应，导致白细胞减少、血小板减少、粒细胞减少。
此外，可以引起肝脏的损伤，出现黄疸型或非黄疸型肝炎、肝衰竭，尤其是对于先前有严重肝病的患者，肝损伤发生率相对增加。
患者还可以出现皮疹、光过敏多形性红斑，还可以出现中毒性上皮坏死脱发，同时可以出现中枢和外周神经系统的病变，表现为失眠、嗜睡、眩晕，感觉异常，严重的也会出现抑郁、幻觉等情况。