新生儿甲状腺功能减低，需要给予口服药物治疗。对于新生甲状腺功能减低，要查甲功五项，有的新生儿表现为促甲状腺素升高或游离T3降低，需要给予口服药物，也就是甲状腺片替代治疗。
服药期间要定期监测新生儿甲状腺功能变化，可以1-2周监测1次。如果服药期间新生儿甲功逐渐降到正常，新生儿甲状腺药物不能突然停药，要逐渐减量，还需要定期监测甲功直至甲功完全正常，才可以完全停药治疗。
如果新生儿出现甲状腺功能减退后，没有给予及时药物治疗，有可能会影响新生儿甲状腺功能，对孩子生长发育都会有很大影响，比如生长发育落后、身材矮小甚至对智力发育造成影响。