拉肚子有酸臭味是因为食物中的脂肪成分没有被消化造成的，人在拉肚子的时候，不管是急性的腹泻，还是慢性的腹泻，都存在一些消化不良的情况。
急性腹泻常常是因感染性因素，比如病菌、病毒，甚至寄生虫感染，造成小肠黏膜的损伤，或者消化、吸收功能的障碍，或者分泌增加，或者一些侵袭性的肠黏膜损伤，导致消化吸收功能下降，致使食物中的脂肪成分不能被及时消化，所以排出以后会有一些酸臭味。
慢性的腹泻，不管是胰腺，还是肝脏方面的疾病，或者小肠方面的疾病，常存在消化不良，甚至有些就是肠易激综合征，因为腹泻的原因，食物在肠道停留比较短暂，或者本身就没有及时消化，所以腹泻大便会有酸臭味。