肛门里面疼得厉害，通常有几大原因，如炎症刺激、异物刺激、化脓性病变等。
1、炎症刺激：比较常见的肛窦炎、肛管炎，或者是直肠炎症刺激比较厉害。
2、异物刺激：比如吃饭的时候，不小心吃下去的鱼骨头、鸡骨头、枣核等，各种异物到达肛门直肠部位的时候，因为没有顺利排出，对于肛门直肠的肠壁或者肛管，会造成直接损伤。
3、化脓性病变：肛门直肠周围的脓肿，这些脓肿由于是细菌感染形成的脓液，局部压力过高，会导致肛门里面非常疼痛。
4、意外刺激：有时很难以找到确切原因，在排除多方面的器质性病变之后，通常会被诊断为肛门直肠痛，也是肛门疼痛的类型之一。
5、其他原因：除了常见的疼痛之外，还有比较少见的情况，比如肛门直肠发生潜在的肛瘘，或者发生比较厉害的、面积相对偏大的湿疹，都有可能造成肛门相对剧烈的疼痛。
所以肛门疼痛的具体原因，需要针对性检查，如肛门镜、指检，必要的时候进行影像学检查，才能够相对明确诊断，针对病因进行治疗。